Detection of multiple human enteropathogens in Norway rats (Rattus norvegicus) from an under-resourced neighborhood of Vancouver, British Columbia.

Urban Norway rats (Rattus norvegicus) can carry various human pathogens, and may be involved in pathogen propagation and transmission to humans. From January 31-August 14, 2021, a community outbreak of Shigella flexneri serotype 2a occurred among unhoused or poorly housed people in the Downtown Eastside neighborhood of Vancouver, British Columbia, Canada. The source could not be identified; however, patients reported contact with rats, and previous studies indicated transmission of rat-associated zoonotic pathogens among the unhoused or poorly housed residents of this neighborhood. The study objective was to determine if rats trapped in the outbreak area were carriers of Shigella spp. and other zoonotic enteric pathogens. From March 23-April 9, 2021, 22 rats were lethally trapped within the outbreak area. Colonic content was analyzed using the BioFire FilmArray Gastrointestinal (multiplex PCR) panel for human enteropathogens, which detected: Campylobacter spp. (9/22), Clostridioides difficile (3/22), Yersinia enterocolitica (5/22), Cryptosporidium spp. (8/22), Giardia duodenalis (5/22), Rotavirus A (1/22), enteroaggressive Escherichia coli (2/22), enteropathogenic E. coli (10/22), and Shigella spp. or enteroinvasive E. coli (EIEC) (3/22). An ipaH PCR assay was used for targeted detection of Shigella spp./EIEC, with five rats positive. Two samples contained insertion sites unique to S. flexneri isolated from the human outbreak. This study highlights the potential for rats to carry a broad range of human pathogens, and their possible role in pathogen maintenance and/or transmission.

A retrospective study of equine perinatal loss in Canada (2007 to 2020).

Objective: This study aims to identify the most common causes of equine perinatal loss up to 7 d of age in Canada. Animal: Equine. Procedure: Necropsy reports from 360 equine perinatal loss cases were acquired from provincial veterinary diagnostic labs across Canada. Each case was classified into a basic cause (noninfectious, infectious, or unidentified) of perinatal loss, then further classified into primary and secondary categories for analysis. Results: Of the basic causes of perinatal loss, noninfectious causes were the most common. Bacterial causes, such as septicemia, were the most common primary diagnosis overall. Actinobacillus was the most commonly identified bacterial species. Conclusion: This study showed similar results to those of studies conducted in other countries, including having similar etiologic agents identified. The high prevalence of thyroid hyperplasia identified in this study is notable and was not reported in other, similar retrospective studies, despite being reported in locations other than Canada. Clinical relevance: Perinatal loss can have important economic consequences for horse breeders; thus, identification of the most common causes is of interest to both veterinarians and breeders.

Étude rétrospective des décès périnataux équins au Canada (2007 à 2020). Objectif: Cette étude vise à identifier les causes les plus courantes de décès périnatal équin jusqu'à l'âge de 7 jours au Canada. Animal: Cheval. Procédure: Les rapports d'autopsie de 360 cas de décès périnatal équin ont été acquis auprès de laboratoires provinciaux de diagnostic vétérinaire à travers le Canada. Chaque cas a été classé selon une cause fondamentale (non infectieuse, infectieuse ou non identifiée) de décès périnatal, puis classé en catégories primaires et secondaires pour analyse. Résultats: Parmi les causes fondamentales de décès périnatal, les causes non infectieuses étaient les plus fréquentes. Les causes bactériennes, telles que la septicémie, étaient le diagnostic principal le plus courant dans l'ensemble. Actinobacillus était le genre bactérien le plus fréquemment identifié. Conclusion: Cette étude a montré des résultats similaires à ceux d'études menées dans d'autres pays, y compris l'identification d'agents étiologiques similaires. La forte prévalence de l'hyperplasie thyroïdienne identifiée dans cette étude est remarquable et n'a pas été signalée dans d'autres études rétrospectives similaires, bien qu'elle ait été signalée dans des endroits autres que le Canada. Pertinence clinique: Le décès périnatal peut entraîner des conséquences économiques importantes pour les éleveurs de chevaux; ainsi, l'identification des causes les plus courantes intéresse à la fois les vétérinaires et les éleveurs.(Traduit par Dr Serge Messier).

A 13-year retrospective study of equine abortions in Canada.

Objective: The purpose of this study was to identify the most common causes of equine abortion in Canada, and to compare findings to similar reports from other countries. Animal: Equine. Procedure: Necropsy reports from 901 equine abortion cases were acquired from provincial veterinary diagnostic laboratories across Canada. The final diagnosis was classified into basic abortion causes (infectious, non-infectious, unknown) and into primary and secondary categories for analysis. Results: Non-infectious causes of abortion were the most frequently identified in Canada, with fetoplacental causes, including umbilical cord torsion or placental insufficiency, being the most common primary diagnosis category. Streptococcus and Escherichia were the bacterial species most often identified as causing infectious abortions, whereas equine herpesvirus-1 was implicated in all viral abortions identified. Conclusion: The high rate of non-infectious causes of abortion was similar to previous studies conducted in the United Kingdom. This finding was somewhat dissimilar to the USA, which had higher rates of infectious abortions, despite Canada's geographic proximity to the USA. The reason for variations among countries in equine abortion causes is unknown. Clinical relevance: The large number of fetoplacental-related abortions identified in this study emphasized the need for submission of both the fetus and placenta, if possible, to increase the probability of a diagnosis. In addition, the high rate of unidentified diagnoses suggests a need for further study into both non-infectious and infectious causes of equine abortion, including potential development of new diagnostic tests or markers.

Objectif: Le but de cette étude était d'identifier les causes les plus courantes d'avortement chez les équidés au Canada et de comparer les résultats à des rapports similaires provenant d'autres pays. Animal: Chevaux. Procédure: Les rapports de nécropsie de 901 cas d'avortements équins ont été obtenus auprès de laboratoires provinciaux de diagnostic vétérinaire à travers le Canada. Le diagnostic final a été classé en causes d'avortement de base (infectieuses, non infectieuses, inconnues) et en catégories primaires et secondaires pour analyse. Résultats: Les causes non-infectieuses d'avortement étaient les plus fréquemment identifiées au Canada, les causes foetoplacentaires, y compris la torsion du cordon ombilical ou l'insuffisance placentaire, étant la catégorie de diagnostic principal la plus courante. Les espèces bactériennes des genres Streptococcus et Escherichia étaient les plus souvent identifiées comme étant à l'origine d'avortements infectieux, alors que l'herpèsvirus équin-1 était impliqué dans tous les avortements viraux identifiés. Conclusion: Le taux élevé de causes non-infectieuses d'avortement était similaire aux études précédentes menées au Royaume-Uni. Cette observation était quelque peu différente de celles des États-Unis, qui avaient des taux plus élevés d'avortements infectieux, malgré la proximité géographique du Canada avec les États-Unis. La raison des variations entre les pays dans les causes d'avortement équin est inconnue. Pertinence clinique: Le grand nombre d'avortements liés aux causes foetoplacentaires identifiés dans cette étude a souligné la nécessité de soumettre à la fois le foetus et le placenta, si possible, pour augmenter la probabilité d'un diagnostic. En outre, le taux élevé de diagnostics non identifiés suggère la nécessité d'une étude plus approfondie des causes non-infectieuses et infectieuses de l'avortement équin, y compris le développement potentiel de nouveaux tests de diagnostic ou marqueurs.(Traduit par Dr Serge Messier).

A comparison of assays for the detection of Cryptosporidium parvum in the feces of scouring calves.

Cryptosporidium parvum is a zoonotic, protozoan parasite that causes potentially life-threatening diarrhea in the host and can be transmitted via the fecal-oral route. C. parvum can infect cattle and may be detected in their feces using a variety of tests. We compared the level of agreement, ease of procedure, and cost among PCR, lateral flow immunoassay, fluorescent antibody, and Kinyoun acid-fast stain direct smear tests. Over the course of 9 mo, 74 calf fecal samples were submitted and tested for C. parvum using all 4 tests. A Fleiss kappa value of 0.813 was obtained, indicating an excellent level of agreement among tests. Overall, the best test based on cost and ease of procedure was the Kinyoun acid-fast stain direct smear.